Forum PAUD Indonesia mempunyai struktur organisasi yang terdiri dari :

• Badan Pertimbangan atau yang tugasnya memberikan pertimbangan dan melakukan pengawasan kinerja organisasi 
  
• Badan Pembina Teknis yang tugasnya memberikan bantuan dan fasilitasi pelaksanaan kegiatan pendidikan (pencerdasan), kesehatan (gizi), pengasuhan serta koordinasi.
• Pengawas yang tugasnya melakukan pengawasan terhadap kninerja organisasi
• Pengurus yang tugasnya Menetapkan Anggaran Rumah Tangga dan Peraturan Organisasi, Melaksanakan Pokok-Pokok Program Kerja Organisasi dan Mempertanggungjawabkan Pelaksanaan Tugas pengurus kepada Musyawarah Nasional. Masa Kepengurusan ditentukan selama 4 (empat) tahun. Untuk periode 2008 – 2012.
  
  
• Untuk pelaksanaan kegiatan operasional sehari-hari, struktur organisasi Forum PAUD Indonesia adalah :

I.    KETUA UMUM 

II.  KETUA HARIAN 

III. SEKRETARIS UMUM 

IV.         KOMISI KIE

V.           BIDANG KESEHATAN dan GIZI

VI.          BIDANG PENDIDIKAN

VII.         BIDANG PENGASUHAN

VIII.        BIDANG PEMBERDAYAAN KELUARGA & MASYARAKAT

IX.      MONITORING dan EVALUASI